pET-48b載體含有N端Trx和His標簽，在標簽后面緊跟著的是HRV 3C蛋白酶切位點。HRV 3C蛋白酶能夠高特異性的識別LEVLFQ↓GP蛋白序列，能夠在低溫下高效切割掉融合標簽序列。pET-48b載體還含有一個可選擇的C端Thrombin蛋白酶切位點，緊接著位點后是S標簽。
pET48b載體的單一的多克隆位點見上面的環狀質粒圖譜。注意：載體序列是以pBR322質粒的編碼規矩進行編碼的，所以T7蛋白表達區在質粒圖譜上面是反向的。
T7 RNA聚合酶啟動的克隆和表達區域在質粒圖譜中也被標注了出來。質粒的F1復制子是被定向的，所以在T7噬菌體聚合酶的作用下，包含有蛋白編碼序列的病毒 粒子能夠產生，并啟動蛋白表達，同時蛋白表達將被T7終止子序列(Cat. No. 69337-3)的作用下終止蛋白翻譯。
載體的單鏈測序應該使用S 18引物(Cat. No. 71262-3)。
